بررسی ایمونوانفورماتیکی پروتئین تروپومیوزین کنه بوافیلوس

زمینه مطالعه: کنه بوافیلوس سبب انتقال برخی از اجرام پاتوژن و کاهش تولید در گاو می شود. پروتئین تروپومیوزین، تنظیم گر فعالیت اکتین بـوده و نقـش مهمـی در واکنش های ایمنی، آلرژی و تهیه واکسن دارد. هدف: روش های مرسوم شناسایی دقیق شاخص های آنتی ژنتیک (اپی توپ ها)،  طاقت فرسا، زمان بر و پرهزینه است، لذا توجه ما در این مطالعه به سمت توسعه روش های سریع تر نظیر پیشگویی اپی توپ های احتمالی مورد شناسایی سلول b و +4tcd ، مبتنی بر توالی و ساختار پروتئین می باشد. روش کار: از گستره وسیعی از برنامه ها و ابزارهای ایمونوانفورماتیک جهت آنالیز آنتی ژنسیتی، فراوانی ساختار ثانویه پروتئین و دومن ها، فاکتورهای فیزیکوشیمیایی مرتبط با مکان اپی توپ های خطی ،اپی توپ های سلول b ، قطعات پپتیدی متصل شونده به آلل های mhc کلاس 2 گاو  استفاده گردید. نتایج: آنالیز پروتئین با الگوریتم های مختلف و انتخاب اپی تـــوپ هـــای مـــورد تـــوافـــق در بـیـشـتــر ابــزارهــا مـنـجـر بـه بـه دسـت آمـدن سـه پپتیـد بـرگـزیـده  بـا خـاصیـت اپـی تـوپـی بـرای سلـول b 80-62-eqlsqanskleekdkalqa-cooh) aa2(nh ، 185-170-amveadleraeeraetg-cooh) aa2(nh  و 218-200-vgnnlkslevseekalqkeet-cooh)aa2(nh و یـــــــک پـــپـــتـــیـــــــد بــــــرای سلـــــول t 207-192-leeelrvvgnnlksl-cooh) aa2(nh گـردیـد. نتیجه گیری نهایی: جهت تحریک رضایت بخش سیستم ایمنی تنها قطعاتی از پـروتئیـن (اپی توپ ها) کافی می باشد. انتخاب اپی توپ های بهینه سبب تمرکزپاسخ ایمنی و تهیه واکسن مناسب شده و از پاسخ های آلرژیک و نامطلوب می کاهد.